Au sud des îles principales du Japon, on trouve des archipels composés d'îles plus petites. Généralement, ces îles ont un climat subtropical, avec des hivers doux et des étés chauds et humides. Les pluies sont abondantes et bien réparties tout au long de l'année.

Ryukyu

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Au sud de Kyushu, nous trouvons les îles Ryukyu, à leur tour divisées en différents groupes, qui atteignent presque le tropique, à l'est de Taiwan.

Osumi

Dans le groupe d'îles le plus au nord (Osumi), l'hiver est doux, avec une moyenne de 11/12 °C en janvier, mais pluvieux et exposé aux vents froids du nord-ouest. Les îles principales du groupe sont Yakushima, Tanegashima et Kuchinoerabu-jima. Voici les températures moyennes de Yakushima.

Les pluies sont particulièrement abondantes, notamment sur l'île de Yakushima, au sein de laquelle se trouve une montagne, qui est l'un des endroits les plus pluvieux au monde. Sur la côte, il tombe 4 650 millimètres par an à Yakushima et 2 500 mm à Tanegashima. Voici les précipitations moyennes à Yakushima.

Dans ces îles, la mer est fraîche en hiver, elle est suffisamment chaude pour se baigner (avec une température égale ou supérieure à 23 degrés) de mai à novembre, et devient agréablement chaude de juillet à septembre.

En allant vers le sud (îles Tokara et Amami), l’hiver devient progressivement plus doux.
Dans les îles les plus méridionales (Okinawa, Miyako - voir Miyakojima, et Yaeyama - voir Ishigaki) l'hiver est si doux qu'il ressemble aux saisons intermédiaires, même si les pluies sont assez abondantes.
À Okinawa, où le climat est presque tropical, la moyenne en janvier est d'environ 17 degrés. Ici il ne gèle et ne neige jamais (v. Naha).

À Okinawa il tombe 2 000 mm de pluie par an, avec un maximum de mai à septembre (mais il y a une pause relative en juillet), et un minimum relatif en hiver, quand il tombe encore environ 100 mm de pluie par mois. Voici les précipitations moyennes.

La mer à Okinawa n'est jamais froide, en fait, la température descend à un minimum de 22 °C en février et en mars, tandis qu'elle devient très chaude en été.

En dehors de ce groupe, au sud-est d'Okinawa, nous trouvons les îles Daito, dont le climat est similaire à celui d'Okinawa, bien qu'un peu moins pluvieux : à Minamidaito, les pluies atteignent 1 600 mm par an.

Izu

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Plus à l'est, dans l'océan Pacifique au sud de Tokyo (Mer des Philippines), on trouve les îles Izu (également appelées îles de Tokyo), qui sont très pluvieuses (bien que pas comme Yakushima) : à Hachijo-jima, les précipitations atteignent jusqu'à 3 000 mm par an. Cependant, l'hiver est la saison la moins pluvieuse.
Les températures deviennent progressivement plus douces au fur et à mesure que nous nous dirigeons vers le sud : à Izu Oshima elles ressemblent encore à celles de la côte sud d'Honshu, en fait la moyenne de janvier est de 7 °C. Voici les températures moyennes à Izu-Oshima.

Plus au sud, à Miyake-jima, la moyenne de janvier s'élève à 9,5 °C, à Hachijo-jima à 10,5 °C, et à Tori-shima à 14 °C. L'île de Nii-jima est située entre Izu-Oshima et Miyake-jima.
Voici les températures moyennes à Miyake-jima.

Ogasawara

Au sud des îles Izu, nous trouvons les îles Ogasawara ou Bonin, qui arrivent aussi presque au tropique, mais sont moins pluvieuses que les Ryukyu : à Chichi-jima et Iwo-jima il tombe 1 300 mm de pluie par année, et à Minamitori-jima seulement 1 000 mm.
Voici les précipitations moyennes à Chichi-jima. Ici aussi, en juillet il y a une diminution relative dans les pluies.

À Chichi-jima, les températures sont similaires à celles d'Okinawa.

Le mois le plus ensoleillé à Chichi-jima est Juillet.

Les typhons

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Les îles au sud du Japon peuvent être frappées par les typhons, les cyclones tropicaux du Pacifique occidental. En effet, ces îles sont souvent plus durement touchées que les îles principales du Japon.
Typiquement, les typhons se produisent de juin à octobre ; de temps en temps, ils se produisaient également avant et après cette période (donc de la fin avril à la fin mai et du début novembre au début décembre). Cependant, ils sont plus fréquents d'août à début octobre.