Le climat des îles San Juan est sub-océanique, avec des hivers assez doux et pluvieux, et des étés doux et assez ensoleillés.
L'archipel est situé au nord-ouest de l'État de Washington, à l'est de l'île canadienne de Vancouver, entre le détroit de Géorgie et le détroit de Juan de Fuca. Les îles principales sont Orcas, San Juan, Lopez, Shaw (les quatre premières, desservies par les Washington State Ferries), Decatur et Blakely.
Même si nous sommes dans une zone humide, les îles sont affectées, en particulier dans la partie sud, par l'ombre pluviométrique générée par les montagnes olympiques. Pour cette raison, les précipitations sont inférieures à 1 000 mm par an, et elles descendent même au-dessous de 500 mm dans la partie la plus méridionale des îles Lopez et San Juan. A Olga, sur l'île Orcas, elles s'élèvent à 735 mm.
Bien que l'hiver soit assez doux, il peut parfois y avoir des vagues de gel, parfois même en novembre, avec des minimales pouvant descendre jusqu'à -7/-8 °C ou même au-dessous. Le vent froid souffle du nord-est, de la vallée du Fraser, et affecte principalement l'île Orcas et les petites îles du nord.
La neige est rare en raison de la prévalence des courants doux de l'océan. En un an, 17 cm de neige tombent sur l'île Lopez.
En été, il est rare qu’il fasse très chaud, en raison de l’influence de l’océan, et même quand c’est le cas, la température baisse beaucoup la nuit. Généralement, la température ne dépasse pas 33/34 °C aux jours les plus chauds, mais parfois elle n'atteint même pas 30 °C pendant un mois entier. Dans la canicule exceptionnelle de fin juin 2021, on a atteint 38 °C à Friday Harbor.
À Friday Harbor, une petite ville située sur l'île de San Juan, la température moyenne du mois le plus froid (décembre) est de 5,3 °C, celle du mois le plus chaud (août) est de 16,4 °C. Voici les températures moyennes.

Les précipitations totalisent 470 mm par an : elles sont donc assez faibles. Dans le mois le moins pluvieux (juillet) il tombe 10 mm de pluie, dans le plus pluvieux (novembre) il tombe 75 mm. Voici les précipitations moyennes.

La température de la mer varie entre 7,5 °C et 13,5 °C. Elle est donc froide toute l'année. Voici les températures moyennes de la mer à Lopez Island.

Quand partir

La meilleure période pour visiter les îles San Juan est l’été, surtout en juillet et août, étant la plus douce, la plus sèche et la plus ensoleillée de l’année. Juin et septembre sont également des mois acceptables.

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