Au Panama le climat est tropical, chaud toute l'année, avec une saison sèche (de janvier à avril) et une saison des pluies (de mai à décembre).
Les précipitations se produisent la plupart du temps sous forme de forte averse ou d'orage dans l'après-midi ou la soirée, mais peuvent continuer même dans les premières heures de la nuit.
Les températures varient peu au cours de l'année, toutefois les mois les plus frais, ou plutôt les moins chauds, sont souvent octobre et novembre, à la fin de la saison des pluies, bien que pendant cette période la chaleur soit désagréable en raison de l'humidité. La période la plus chaude est généralement mars-avril, c'est-à-dire avant la saison des pluies.

Il y a aussi des zones qui ont un climat équatorial, c'est-à-dire sans une saison sèche: le nord-ouest, près de la frontière avec le Costa Rica (sur le côté nord de la chaîne de montagnes appelée cordillère de Talamanca, où il y a le parc international La Amistad, occupé par une forêt de nuages), et le sud-est, c'est-à-dire la région de Darien à la frontière avec la Colombie, dominée par une forêt impénétrable (tant et si bien que même la route panaméricaine, qui autrement relierait le continent américain de l'Alaska à la Patagonie, s'arrête au sud de Yaviza). Dans la première zone (v. Changuinola), où il tombe environ 2.500 millimètres de pluie par an, il y a deux périodes où les pluies connaissent une baisse relative: à septembre-octobre et à février-mars, quand il tombe de 100 à 150 mm de pluie par mois, tandis que les mois les plus pluvieux sont juillet, septembre et décembre. Dans la deuxième zone, la région de Darien, où il tombe plus de 3.000 millimètres de pluie par an, la seule période au cours de laquelle on descend à environ 150 mm par mois va de janvier à mars.

À l'exclusion de la région du Darién, où il pleut beaucoup sur les deux côtés, généralement le côté des Caraïbes est plus pluvieux que celui du Pacifique, principalement parce que les vents dominants en hiver sont les alizés du nord-est, qui déchargent l'humidité sous forme de pluie sur les chaînes de montagnes qui traversent l'intérieur du pays comme une épine dorsale, en particulier dans le centre-ouest.
À Panama (ou Ciudad de Panama), la capitale, située dans le versant sud, il tombe environ 1.700 millimètres de pluie par an, presque tous dans la saison des pluies, de mai à la mi-décembre. Cette période est aussi étouffante et peu ensoleillée.
Voici la moyenne des précipitations.
Précipitations moyennes - Panama

Panama	Jan	Fév	Mar	Avr	Mai	Jui	Jui	Aoû	Sep	Oct	Nov	Déc	Année
Panama	J	F	M	A	M	J	J	A	S	O	N	D	An
Préc. (mm)	40	16	17	75	200	205	185	190	195	225	250	130	1728
Jours	3	2	1	4	11	12	11	11	12	13	13	8	101

En échange, la période de janvier à la mi-avril est ensoleillée et il ne pleut presque jamais, même s'il fait très chaud, avec des minimales autour de 23/24 °C et des maximales autour de 32 degrés.
Voici les températures moyennes.
Températures moyennes - Panama

Panama	Jan	Fév	Mar	Avr	Mai	Jui	Jui	Aoû	Sep	Oct	Nov	Déc
Panama	J	F	M	A	M	J	J	A	S	O	N	D
Min (°C)	23	23	23	24	24	24	24	24	23	23	23	23
Max (°C)	31	32	32	32	31	30	30	30	30	29	30	30

Sur le versant nord, à Colón, à l'entrée caraïbe du canal de Panama, la pluviométrie est la même, mais le montant est presque le double (3.300 mm). Dans le mois le plus pluvieux, novembre, les pluies sont de type mousson, dépassant les 550 mm en un mois. En outre, ici les pluies sont encore très abondantes en décembre. Au nord-est de Colón il y a l'archipel de San Blas, formé par des îles de corail, et habités par les Indiens Cuna.
Ici, la moyenne des précipitations à Colón.
Précipitations moyennes - Colon

Colon	Jan	Fév	Mar	Avr	Mai	Jui	Jui	Aoû	Sep	Oct	Nov	Déc	Année
Colon	J	F	M	A	M	J	J	A	S	O	N	D	An
Préc. (mm)	95	50	45	125	360	340	380	360	310	395	550	340	3355
Jours	9	7	7	9	19	20	22	23	19	22	24	17	198

Le versant sud, sous le vent, est donc un peu plus chaud et moins humide que celui du nord. Dans la côte sud (v. Panama), la température moyenne du mois le plus chaud (avril) est de 28 degrés, celle des mois les plus frais (octobre et novembre) de 26 °C. Au contraire, sur la côte nord on va de 25 degrés en novembre et décembre, à 27 °C en avril et mai.



Pour trouver un peu de fraîcheur il faut monter au-dessus de 1.000 mètres, dans les tierras templadas, qui ont un climat plus doux. À Boquete, à 1.200 mètres, sur les pentes du volcan Barú (le plus haut sommet au Panama avec ses 3.475 mètres), la température moyenne quotidienne varie entre 20 et 21 degrés toute l'année.
Températures moyennes - Boquete

Boquete	Jan	Fév	Mar	Avr	Mai	Jui	Jui	Aoû	Sep	Oct	Nov	Déc
Boquete	J	F	M	A	M	J	J	A	S	O	N	D
Min (°C)	15	15	16	17	17	17	17	17	16	16	16	15
Max (°C)	26	26	27	27	26	25	26	26	25	25	25	25

Au-dessus de 2.000 mètres, dans les tierras frías les nuits peuvent être froides, surtout dans la période de décembre à mars. Au-dessus de 3.000 mètres, il peut faire froid même pendant la journée.



Partout dans la plaine méridionale à l'ouest du golfe du Panana (v. David, Santiago), et dans la péninsule d'Azuero, les pluies descendent au-dessous de 100 mm déjà en décembre; au cours de la saison sèche, le soleil prédomine le long de la côte et la canicule règne dans les régions de l'intérieur, avec des maximales autour de 35 degrés dans les régions intérieures.
Voici les températures moyennes de Santiago de Veraguas.
Températures moyennes - Santiago

Santiago	Jan	Fév	Mar	Avr	Mai	Jui	Jui	Aoû	Sep	Oct	Nov	Déc
Santiago	J	F	M	A	M	J	J	A	S	O	N	D
Min (°C)	20	20	20	22	22	22	22	22	22	22	21	21
Max (°C)	32	33	34	34	32	31	31	31	31	30	31	31

Au sud de la côte méridionale, il y a l'île intacte de Coiba, où se trouve le parc national du même nom, et qui est également un site du patrimoine mondial de l'UNESCO.
Dans les provinces d'Herrera, Los Santos et Cocle, dans la partie qui donne sur le golfe de Panama (v. Anton, Chitré, zone entourée en rouge clair), les précipitations descendent jusqu'à 1.500 millimètres par an. Dans cette région la végétation devient moins dense, si bien qu'il y a aussi des prairies et des arbustes. À l'intérieur il y a même un désert, dans le parc national Sarigua, en vérité plus en raison de la déforestation réalisée par les colons dans le dernier siècle pour faire place à des pâturages, qu'au climat.

L'ensoleillement au Panama n'est pas exceptionnel, parce qu'il peut toujours y avoir des bancs de nuages; il est toutefois meilleur en pleine saison sèche, de février à avril. D'autre part, même dans la saison des pluies, le soleil fait son apparition en moyenne pendant quelques heures par jour, au moins dans les plaines et le long des côtes. Les zones les plus nuageuses sont celles de l'est, vers la frontière avec la Colombie, et les zones montagneuses intérieures. Voici les heures d'ensoleillement par jour dans la capitale.
Ensoleillement - Panama

Panama	Jan	Fév	Mar	Avr	Mai	Jui	Jui	Aoû	Sep	Oct	Nov	Déc
Panama	J	F	M	A	M	J	J	A	S	O	N	D
Soleil (heures)	7	8	8	7	7	6	6	6	6	5	6	6

La mer au Panama est assez chaude pour se baigner toute l'année: la température de l'eau va de 27 °C à 29 °C. Et cela vaut pour les deux côtes.
Température de la mer - Panama

Panama	Jan	Fév	Mar	Avr	Mai	Jui	Jui	Aoû	Sep	Oct	Nov	Déc
Panama	J	F	M	A	M	J	J	A	S	O	N	D
Mer (°C)	27	27	27	27	28	29	28	28	29	29	28	28

Le Panama est presque toujours épargné par les ouragans, qui passent à une latitude plus élevée. Le seul ouragan à frapper le Panama dans les temps historiques a été Martha, qui a suivi une trajectoire anormale (du nord au sud) et a touché la côte dans la baie Mosquito en novembre 1969; plus récemment, deux ouragans, Otto en novembre 2016 et Nate en novembre 2017, ont affecté le Panama bien qu'ils se soient déplacés plus au nord, sur la mer des Caraïbes. Cependant, la saison des ouragans va de juin à novembre, bien qu'à cette latitude si basse ils se forment presque toujours à la fin de la période, c'est-à-dire en octobre et novembre.


Le meilleur moment pour visiter le Panama, pour faire des vacances à la mer ou pour visiter les villes et les parcs, est de janvier à la mi-avril, et en particulier les mois de février et mars: presque partout, il fait chaud, il fait beau et les pluies sont rares, sauf sur la côte des Caraïbes et dans le sud-est (province du Darién), où les pluies sont assez fréquentes même pendant cette période.
Dans le sud-ouest, la zone cerclée en bordeaux, vous pouvez aller même en décembre.


Dans les plaines et les côtes: des vêtements très légers, un sweat-shirt léger pour le soir et pour l'air conditionné; dans la saison des pluies (donc de mai à la mi-décembre à Panama, et tout au long de l'année dans les zones au climat équatorial), un imperméable léger ou un parapluie pour les orages. Pour le récif, équipement de plongée, chaussures d'eau ou avec semelle en caoutchouc.
Pour les tierras templadas: toute l'année, des vêtements légers, un sweat-shirt ou un pull pour le soir; parapluie ou imperméable dans la saison des pluies. Pendant la saison sèche, chapeau de soleil et crème solaire.
Pour les tierras frías: toute l'année, vêtements de mi-saison, t-shirt pour la journée, sweat-shirt ou pull et veste pour le soir, parapluie ou imperméable dans la saison des pluies.
Pour la haute montagne: vêtements chauds, anorak, bottes de randonnée.